Euroscarf (EUROPEAN SACCHAROMYCES CEREVISIAE ARCHIVE FOR FUNCTIONAL ANALYSIS) . Euroscarf菌株保藏中心(德國Euroscarf保藏中心、Euroscarf質粒保藏中心、德國Euroscarf國際保藏單位)成立于1999年,是德國的國家酵母菌種保藏中心。該中心一直致力于酵母菌種,酵母質粒,酵母載體等的保藏工作。
Euroscarf菌種質粒保藏中心成立用于儲存和運送基因組分析網絡中產生的生物材料。Euroscarf酵母菌種載體保藏中心主要包括以下項目:BMBF(325 ORF)、EUROFAN I(800 ORF)和EUROFAN II,作為全球酵母基因缺失項目(6000 ORF)的一部分。如果可以獲得的情況下,含有基因缺失盒或互補基因的質粒也會被儲存起來。各種基因缺失菌種的遺傳背景因項目而異,在很多情況下,你可以選擇不同的基因背景酵母菌種。
德國酵母功能分析項目
在德國酵母功能分析項目(1994-1997)中,有325個基因被刪除。15個實驗室的合作致力于基因缺失和缺失菌株的功能分析(Entian等人:Mol Gen Genet 262(1999)683-702)。所有缺失菌種基因均在CEN.PK2菌株中完成。由于該項目的早期啟動,大多數基因缺失是通過用營養缺陷標記替換感興趣的基因來完成的。約三分之一的缺失是通過PCR技術進行的。由于這個原因,有各種各樣的轉化標記用以取代基因。從這個項目中,EUROSCARF既有交配型的單倍體菌株,也有雜合型的二倍體菌株。只有雜合子二倍體可用于必需基因。該項目產生的菌種可以通過在登錄號中的前一個B,后跟一個4位數字代碼和一個終端字母來識別。
Europan I 酵母基因項目
這項由115個團體組成的合作得到了歐洲聯盟的支持。該項目始于1996年1月,刪除并分析了800個開放閱讀框。每個參與實驗室負責刪除和初步分析6個基因(six pack)。Wach等人已經制定了刪除策略 (Yeast 10 (1994) 1793-1808)。該策略基于PCR片段來刪除相應的開放閱讀框架。這些缺失存在于三種不同的遺傳背景中。所有的開放閱讀框必須在酵母菌種FY1679的背景下刪除。該菌種與S288C相同,后者是釀酒酵母基因組測序的菌種來源。除此之外,在CEN.PK2或W303中還產生了一組額外的缺失菌種,以證明基因缺失是通用的。在**階段構建的應變由5位數字代碼識別,該數字代碼位于對應于應變匹配類型的加入號后面,然后是端子字母。
根據EUROFAN I項目的指導原則,所有基因敲除質粒也被收集。除此之外,大多數基因的質粒可用于缺失基因的互補。
全球基因敲除項目(EUROFAN II)
在全球范圍內,歐洲和海外實驗室聯合在酵母菌基因組缺失項目的聯合體中(Winzeler等人:Science 285(1999)901-906)。歐洲任務被稱為EUROFAN II項目。所有已構建的菌株將由EUROSCARF收集。這些缺失株是在與已確定其DNA序列的釀酒酵母菌株S288c等基因的遺傳背景下進行的。**階段構建的缺失株均為副株系的遺傳背景。
這些菌株的EUROSCARF登錄號不同于酵母菌基因組缺失項目僅通過前一個字母Y給出的登錄號。